Hvad er en virus?
Hvad består de af? | Snyltende arvemateriale (DNA eller RNA) med virion stadie, som kan inficere en vært og producerer kopier af sig selv.
Obligate parasitter (kan ikke reproducerer eller metaboliserer selv).
Inficerer prokaryoter = virus eller bakteriofag
Inficerer eukaryoter = virus
Består af nukleinsyre (arvemateriale) og beskyttende proteinlag (capsid) |
Hvad er en virion
Nævn de to typer | Virion = virus partikel omsluttet af capsid. Spredningsstadiet.
1. Nøgen virus
- arvemateriale omsluttet af proteinkapsel (capsid)
2. Kappeklædt virus
- arvemateriale omsluttet af proteinkapsel + fosfolipid dobbeltmembran
Dannes ved knopskydning af værtscellen (tager noget af membranen med) |
Nævn de tre typer carpsid morfologi | Capsider er opbygget af protein (capsomer)
-Icosahedral
-Cylindrisk
-Binal (har hale-fibre) |
Forklar deres genetiske information (arvemateriale)
- hvad koder de for? | Koder for få gener:
- strukturelle proteiner
- replikations proteiner
- regulatoriske proteiner (styrer livscyklus)
- proteiner involveret i værtscelle infektion og lysering.
Ofte 10-100 gener.
INGEN proteiner til metablisme eller proteinsyntese. |
Forklar deres arvemateriale
- hvilken typer er der | De kan bestå af enten DNA eller RNA.
DNA: Enkelt eller dobbelt strenget
RNA-virus: Enkelt eller dobbelt strenget. (De har RNA replicase)
Retrovirus: Enkeltstrenget RNA med DNA intermediat. (De har reverse transcriptase) |
Forklar replikationen af virus for de forskellige typer af genomer: | dsDNA:
Rolling circle amplifikation, hvor et enzymer laver "nick" der primer polymerasen - den kan køre langt grundet den cirkulære template.
Herefter klippes DNA i individuelle kromosomer der pakkes i capsider.
ssDNA(+):
Syntetiserer anden streng -> ds DNA intermediat -> - streng -> mRNA (+)
+ streng RNA:
Svarer til mRNA og kan direkte bruges til translation. Replikeres vha RNA replicase enzym, hvorved - streng dannes. Herefter kan den bruges som template til dannelse af + streng.
- streng RNA:
RNA replikase laver + streng ud fra - strengen. Herefter kan + strengen bruges til translation -> virus proteiner. (Derfor har - streng RNA virus RNA replicase enzymer med i pakken).
Ud fra + streng kan ny -streng kopieres.
Retrovirus:
Dens RNA bliver lavet om til DNA (revers transkriptase og integrase) -> sætter sig i værtens genom (provirus) -> værsten RNA polymerase laer + RNA.
Herefter transcriperes det til RNA, som kan traslateres og sprede sig. |
Forklar virus livscyklus
Hvad er de 5 steps i den lytiske?
Hvad med den lysogene? | Lytiske livsstadie:
1. Genkende og fasthæfte. (Genkender via specifikke molekyler på overfladen, der binder til receptorer på virion).
2. Penetrerer cellen og komme ind i den
3. Virusen skal translateres og syntetiseres så dens proteiner dannes
4. Herefter samles proteinerne (pakkes) til nye viruspartikler. (Packing motor via ATP)
5. Frigivelses fasen (lysis) -> virioner spredes.
Lysogen livsstadie:
Penetration -> Virus DNA integreres i værts genom = profag.
Værtscellen deler sig med virus DNA i sig.
Repressor protein nedbrydes -> der sker syntese af nuklein syre og proteiner. |
Forklar hvordan de forskellige virusers infektion | Binal bakteriofag:
Sætter sig fast -> laver en "tale tube" -> sender genom ind.
Kan også sende det igennem transport proteiner.
Kappeklædte:
Indhyllet virus kan trænge ind via fusion eller fagocytose (kun eukaryote værter)
Her pakkes virus ud i cyloplasma.
DNA virus replikation foregår i nucleus. |
Hvordan beskytter værtsceller sig mod virus?
Hvad kan virus gøre ved det? | Prokaryoter
CRISPR :
Genkender virus ved at have lidt at virussen i sit DNA -> laver CRISPR RNA (immunisering).
Cas proteiner med RNA genkender og binder til virus sekvenser og klipper det ud af RNA og derefter klipper det stykker (det genkender det)
Restriktion modifikation systemer:
- Restriktion enzymer kløver dobbeltstrenget DNA ved specifikke basesekvenser.
- Systemer til modifikation af værtens eget DNA så det ikke kløves af restriktionsenzymer.
Ændre deres overfladeproteiner
Forsvar:
Kemisk modifikation af virus DNA - genkendes ikke af restriktions enzymer.
Produktion af proteiner, der inhiberer værtscelle restriktionsenzymer.
Beskytte mod CRISPR RNA vha kapsel.
Mutere hurtigt. |
Forklar forskellen på virus og bakterier | Virus:
- ingen cellevæg eller membran
- ingen reproduktion selv
- ofte RNA som arvematerialle
- ingen metabolisme
Bakterier / prokaryoter:
- cellemembran
- reproducerer selv
- har altid DNA som arvemateriale |
Forklar forskellen på virus i eukaryoter vs prokaryoter | Pro:
Kun den virale nukleinsyre der kommer ind i værtscellen.
Eukaryoter:
Hele vironet optages i plante-dyreceller.
Indeholder en kerne, hvor de fleste vira replikeres.
Virale fabrikker - øger hastigheden af dannelse af virioner og beskytter processen fra værtens forsvar. |