| Hvorfor er populationsstruktur vigtigt i konservation? | Stor genetisk forskellighed mellem populationer.
Hver population kan være en conservation unit.
Hvor starter en population, hvor slutter den – vigtigt at vide for conservationen. |
| Hvad betyder isolation by distance? | Når genetisk distance afhænger af geografisk distance. |
| Hvad er Fst?
Hvordan beregnes den?
Hvad kræver det før man kan fortolke på Fst? | Mål for afvigelse på allelfrekvenser mellem subpopulationer.
Dermed også et mål for genetisk afvigelse mellem subpopulationer.
Fst kan også bruges som mål for inbreeding, hvor man sammenligner en subpopulations mængde inbreeding med f.eks. hele arten som base population.
Hs: Gennemsnit af alle subpopulationernes forventede HW heterozygositet
Ht: Forventet HW heterozygositet hvis hele basepopulationen er panmictic (random parring).
Fst = 0: Alle subpopulationer har ens allelfrekvenser (panmixia).
Fst = 1: Alle subpopulation er fixed for forskellige alleler.
Man kan ikke rigtig fortolke på Fst medmindre man kender til migrationsrate og effektiv populationsstørrelse.
Høj migrationsrate og høj populationsstørrelse giver lav Fst (mere genflow og mindre drift). |
| Hvordan påvirker selektion Fst? | Selektion påvirker Fst, men det afhænger af hvilken type selektion:
Overdominans (Heterozygoter større fitness): Fst bliver lavere (forestil dig at der er mindre sandsynlighed for fixede alleler når der er overdominans).
Retningsselektion: Fst bliver højere (hvis altså den direktionelle selektion er forskellig mellem populationerne der sammenlignes ved beregning af Fst). |
| Forklar Wahlund effekten | Wahlund effekten er når der er underskud af heterozygoter (ift HW-proportioner) pga. subpopulationsstruktur (altså at én population er delt op i flere seperate små populationer). Populationsstørrelsen er mindre og drift kan fx have større betydning.
Ses fx i torsk. |
| Forklar Island model | Island model:
Kombinerer effekterne af genflow og genetisk drift (modvirker hinanden).
Selve modellen:
Forestil dig at du har flere subpopulationer med N effektiv populationsstørrelse. Populationerne udveksler individer mellem hinanden med raten m. Hver population bidrager til en migrant pool med det samme antal migranter.
Hver generation bliver individerne i subpopulationerne m-antal migranter og 1-m antal local population.
I populationer der følger island modellen er der ingen sammenhæng mellem genetisk afvigelse mellem populationerne og geografisk afstand.
Der vil være genflow mellem subpopulationerne, hvilket vil få Fst til at falde. Samtidig vil drift (alt efter størrelse på subpopulationerne) få Fst til at stige. Så længe m > 0, vil Fst have en form for steady-state equilibrium, hvor effekterne af drift og genflow er balanceret.
Der skal meget lidt genflow til for at populationerne er connected og det påvirker derfor meget nemt Fst.
Fst i island modellen afhænger KUN af antallet af migranter (mN) og IKKE af størrelsen på subpopulationerne (N), selvom det er mega counter-intuitivt. Dette skyldes at Fst afhænger af de modsatrettede kræfter, drift og genflow, og noget med hvordan driften og populationsstørrelsen hænger sammen, der så udligner.
Arter med større lokale populationer (N) forventes at have mindre genetisk afvigelse fra hinanden (mindre Fst) end arter med samme mængde genetic exchange (m) og mindre lokale populationer (N). |
| Forklar stepping stone modellen
- forskellen på Island model? | I stepping-stone modellen tages der højde for at migrationen mellem nærliggende populationer er større end ved populationer langt fra hinanden (short-range migration og long-range migration).
Lineære stepping-stone models bruges om populationer med en-dimensionel lineær struktur, f.eks. langs en flod, bjergryg eller dal.
To-dimensionelle stepping-stone models bruges om populationer med en slags gitter struktur (skak-plade agtigt).
I stepping-stone modellen får migration ikke Fst til at falde ligeså meget som ved Island modellen (og modvirker derfor ikke ligeså meget driften), fordi subpopulationerne der har genflow mellem hinanden ligner hinnanden mere i stepping-stone end i island-modellen. Derfor vil Fst for populationer med stepping-stone modellen som regel være højere end for populationer med Island-modellen.
Genetisk afvigelse mellem populationer afhænger meget af den geografiske distance i stepping-stone. Populationer med stepping-stone modellen viser isolation by distance mønster.
Man vil tit finde en blanding mellem de to modeller. Det er lidt urealistisk at Island modellen findes i naturen alene (Stepping-stone model er mest realistisk.) |
