Hvad er en effektiv populations størrelse?
Hvilke parametre antager man når man måler Ne? (hvilke medfører det er anderledes fra det aktuelle antal af individer)? | Ne er størrelsen på den ideelle (Wright-Fisher) population (N) som vil resultere i den samme mængde genetiske ændringer (drift eller inbreeding), som i den aktuelle population.
Ne er antages næsten altid at være lavere end N (antal individer).
Måles ud fra:
• lige sex ratio
• lige sandsynligheder for at bidrage til næste generation
• konstant populations størrelse
• non-overlapping generationer
Sex ratio, Overlapping generations og Varians i antallet af offspring medfører Ne er anderledes fra cN. |
Forklar Ne/Nc ratios
Hvilke faktorer påvirker denne ratio (ved at sænke Ne)? | Nc er antallet af individer i populationen (census population size).
I gennemsnit 0,1 bruges som tommelfingerregel. Kan bruges til at beregne effektiv populationsstørrelse.
Kan også bruges som et mål for hvornår en population er conservation concern.
- den skal gerne være lav, så populationsstørrelsen ikke nærmer sig Ne.
Faktorer der påvirker ratioen (ved at sænke Ne):
Temporale udsving af Ne spiller størst rolle og sænker rationen af Ne/Nc i størst grad - vigtigt at undgå bottleneck.
Sex ratio og variation i antallet af offspring kan også sænke Ne/Nc ratioen. |
Hvordan estimerer man den effektive populations størrelse? | Lang varige observationer, tælle individer, lave pedegri af population for at se på variance i deres reproduktive succes.
Tælle individer og antage en bestem Ne/N ratio - estimere Ne ud fra det. (Ikke så god måde)
Analyserer genetiske markers, estimere drift og estimere Ne ud fra dets relation med drift. |