| Forklar termen lokal adaptation
Hvordan viser man det er tilstede, hvilke to måder findes der? | Arvelige forskelle i træk der giver en population højere fitness i dens ’hjemme’ miljø sammenlignet med en ’fremmed’ population i samme miljø.
For at vise at der er local adaptation skal man kunne vise at der er forskel mellem populationer på det træk eller gen man kigger på. Man skal også kunne vise at trækket/genet er arveligt.
Og vigtigst skal man kunne vise at forskellene mellem populationer skyldes selektion og ikke drift.
Man kan undersøge om der er local adaptation på forskellige måder:
- Med en quantative genetics approach kan man beregne det ved Qst-Fst (de kan direkte sammenlignes).
- Med en Molecular genetic og genomics approach laver man genome scans. |
| Forklar reaction norm | Phenotypic plasticity - muligheden for en genotype at producerer forskellige fænotyper grundet forskellige miljømæssige forhold.
En funtkion der beskriver hvordan en fænotype af en givet genotype ændrer sig med miljøet. |
| Forklar Selective sweep | Når der er reduceret variation på et gen pga. positiv selektion for én allel.
Det ses ved højere Fst ved et gen sammenlignet med andre gener.
Geneflow og drift forventer man har samme effekt på alle loci i et genom.
Selektion har forskellig effekt på loci i et genom (Hitchhiking selektion sker når en polymorphism er i koblings uligevægt med et andet locus som undergår selektive sweep). |
| Forklar Genome Scan | Analyserer mange mange loci, som er random fordelt på genomet (SNP's).
Man laver en outlier test (locus der visser forskellig mønster af variation end andre) - selektion.
Kan gøres på flere måder.
En simpel test er at beregne Fst henover genomet og se om nogen regioner der har højere Fst end andre.
Fx havvand og ferskvand fisk: Regioner med høj Fst mellem de to slags. Samme regioner i forskellige populationer. Adaptation er ikke kun lokalt - mere forskelig miljøtype (salt/fersk). Parallel evolution er ikke kun fænotypisk men også på genom level. |
