Hvordan kan virus overkomme cellernes forsvar mod dem (fx hvordan bakteriofager overkommer bakteriers CRISPR system)?

Hvis virussen har en høj mutationsrate i det område som bakteriens spacere kan genkende (PAM), kan virussen ikke genkendes selvom den før har inficeret bakterien fordi det dannede CRISPR RNA (crRNA) ikke kan baseparre med det DNA som kommer ind fra virussen. Fx kolera virus har sit eget CRISPR system som nedbryder CAS proteiner fra cellen (dermed ødelægger virus cellens CRISPR system så cellen ikke kan nedbryde virussen) Virus kan have proteiner som inhiberer CAS proteinernes kløvning Bakteriers eget DNA er methyleret så CRISPR ikke ødelægger det, og dette kan virus udnytte ved at methylere deres eget DNA så det ikke nedbrydes af CRISPR systemet. Er der methylering kan CAS proteinerne ikke binde.