SEARCH
You are in browse mode. You must login to use MEMORY

   Log in to start

Genetika II


🇬🇧
In English
Created:


Public


0 / 5  (0 ratings)



» To start learning, click login

1 / 25

[Front]


kodonas
[Back]


Groups of three nucleotide bases form a codon that specifies one of the 20 naturally occurring amino acids used in protein synthesis.

Practice Known Questions

Stay up to date with your due questions

Complete 5 questions to enable practice

Exams

Exam: Test your skills

Test your skills in exam mode

Learn New Questions

Dynamic Modes

SmartIntelligent mix of all modes
CustomUse settings to weight dynamic modes

Manual Mode [BETA]

The course owner has not enabled manual mode
Specific modes

Learn with flashcards
Complete the sentence
Listening & SpellingSpelling: Type what you hear
multiple choiceMultiple choice mode
SpeakingAnswer with voice
Speaking & ListeningPractice pronunciation
TypingTyping only mode

Genetika II - Leaderboard

0 users have completed this course. Be the first!

No users have played this course yet, be the first


Genetika II - Details

Levels:

Questions:

49 questions
🇬🇧🇬🇧
Kodonas
Groups of three nucleotide bases form a codon that specifies one of the 20 naturally occurring amino acids used in protein synthesis.
Anticodone
A three-nucleotide codon sequence in the mRNA base-pairs with a three-nucleotide antico don sequence in the transfer RNA
Ateniuatorius
This stem-loop structure, referred to as the terminator, or attenuator, causes transcription of the operon to be terminated.
Promotorius
The DNA region that RNA polymerase associates with immediately before beginning transcription is known as the promoter.
Atviras promotoriaus kompleksas
After the holoenzyme induces the DNA to dena- ture in a small region, the RNA polymerase and DNA form an open promoter complex
A consensus sequence.
If, however, some variation appears in the sequence, but certain nucleotides occur at a high frequency (significantly greater than by chance), we refer to those nucleotides as mak- ing up a consensus sequence.
Closed promoter complex
This initiation complex is initially referred to as a closed promoter complex because the DNA has not denatured in the promoter region
Operon
An operon is several genes that encode proteins that are involved in a related process, which are expressed on a single mRNA that is under the transcriptional control of a single promoter.
Intronas
These intervening sequences, or introns, are transcribed RNA sequences that are removed in the nucleus before the mature RNA is transported into the cytoplasm
Exons
The segments of the gene between the introns, which are transcribed and pres- ent in the mature RNA molecule are termed exons.
Spliceosome
The protein–RNA complex required for the removal of the introns from nuclear pre-mRNA is called a spliceosome.
Alternatyvus sigma faktorius
Pvz, sigma32. Apsaugo nuo neigiamo temperatūros poveikio. Htpr genas saugo info apie ši faktoriu, jis jungiasi prie HSP geno promotoriaus.
Baltymai aktyvatoriai
Reguliaciniai baltymai, skatinantys transkripciją, vadinami aktyvatoriais
Baltymai represoriai
Reguliaciniai baltymai, slopinantys transkripciją, vadinami represoriais
Bendrieji transkripcijos faktoriai
Transkripcijos faktoriai leidžia RNR polimerazei prisijungti prie promotoriaus ir suformuoti uždarą promotoriaus kompleksą  Po prisijungimo DNR denatūruojama, susiformuojant pūslei, vadinamai atviru polimerazės kompleksu arba tiesiog atviru kompleksu
CpG sala
CpG salos yra genomo srityse, kuriose yra didelis CpG kiekis – Jų ilgis yra 1-2 KB – Išsidėsčiusios kelių šimtų bazių porų atstumu prieš srovę arba pasroviui nuo transkripcijos starto vietos cpg sailensina gena CG pasikartojimų ruožai(kuriuos CpG nustato gretimose bazėse, o ne bazių porose). šios sekos randamos promotoriuose ir transkripcijos pradžios regionuose daugelyje genų, gali būti metilinamos, kad mažintų geno raišką
Domenas
Transkripcijos faktorių baltymai turi regionus, vadinamus domenais, atliekančius specifines funkcijas  Vienas domenas gali būti jungimosi su DNR vieta  Kitas domenas gali būti jungimosi su efektoriaus molekulėmis vieta  Motyvas yra domenas ar jo dalis, kurio(s) struktūra yra labai panaši daugelyje skirtingų baltymų
Motyvas
Motyvas yra domenas ar jo dalis, kurio(s) struktūra yra labai panaši daugelyje skirtingų baltymų
Esminiai genai
Nereguliuojami genai vadinami esminiais (constitutive)  Jų raiškos lygis iš esmės yra pastovus  Dažniausiai esminiai genai koduoja baltymus, būtinus organizmui išgyventi
Genetinis kodas
Kodonus sudaro 3 bazės • Nepersidengiantis • Perteklinis/išsigimęs (daugiau nei vienas kodonas koduoja kai kurias aminorūgštis) • Iššifruotas naudojant dirbtinai susintetintas mRNR (pvz., poliU) ar trinukleotidus
Geno raiška
Genų raiška (ekspresija) yra procesas, kurio metu ląstelėse geno DNR seka yra verčiama į transkripto RNR seką, o po to dekoduojama iki aminorūgščių sekos polipeptide.
Histonų kodas
Histonų kodo hipotezė sako, kad modifikacijos specifiškai keičia genetinio kodo realizavimą • Histonų variantų įjungimas į nukleosomas vietoje kanoninių histonų
Histonų variantai
Histono 3 variantai – Histonas H3.3 dalyvauja transkripcijos aktyvacijoje – CENPA (Centromere Protein A) baltymas yra būtinas centromeros chromatinui susiformuoti • H2A variantai – mH2A pakeičia standartinį histoną H2A, vykstant X chromosomos inaktyvinimui – H2AZ aktyvina transkripciją • Histonų variantų įsijungimui į chromatiną padeda kiti baltymai
Induktoriai
Kai kada mažos efektorių molekulės gali sustiprinti transkripciją  Tokios molekulės vadinamos induktoriais  Induktoriai veikia dviem būdais  Prisijungia prie aktyvatorių ir paskatina juos jungtis prie DNR  Prisijungia prie represorių ir neleidžia jiems jungtis prie DNR  Genai, reguliuojami tokiu būdu, yra vadinami indukuojamais
Indukuojami genai
Kai kada mažos efektorių molekulės gali sustiprinti transkripciją  Tokios molekulės vadinamos induktoriais  Induktoriai veikia dviem būdais  Prisijungia prie aktyvatorių ir paskatina juos jungtis prie DNR  Prisijungia prie represorių ir neleidžia jiems jungtis prie DNR  Genai, reguliuojami tokiu būdu, yra vadinami indukuojamais
Inhibitoriai
Inhibitoriai jungiasi prie aktyvatorių ir neleidžia jiems prisijungti prie DNR
Koduojanti grandinė
DNR grandinė, kuri yra transkribuojama, vadinama matricine grandine  Priešinga jai grandinė yra vadinama koduojančia grandine arba reikšmine grandine
Korepresoriai
Korepresoriai veikia prisijungdami prie transkripcijos faktorių, jau prisijungusių prie DNR. Daugelis transkripcijos faktorių, priklausomai nuo situacijos, gali veikti ir kaip aktyvatoriai, ir kaip represoriai.
Neigiama transkripcijos kontrolė
Transkripcinė reguliacija, vykdoma represorių, vadinama neigiama kontrole
Operonas
Operonas yra reguliacinis genomo vienetas, sudarytas iš kelių struktūrinių genų, kontroliuojamų vieno promotoriaus  Jis koduoja policistroninę mRNR, turinčią dviejų ar daugiau struktūrinių genų koduojančias sekas  Jis leidžia bakterijai koordinuotai reguliuoti grupę genų, kurie koduoja baltymus, atliekančius panašias funkcijas
Perteklinė kontrolė
Kai kurie aminorūgščių sintezės operonai yra reguliuojami tik per ateniuacijos mechanizmą – Histidino operonas (his) E. coli, kuriame lyderio peptide yra 7 histinai iš eilės; – trp operonas B. subtilis, kuriam reikia 11 triptofano molekulių ateniuacijai vykti. • Kitais atvejais yra būdinga perteklinė kontrolė, t.y. operoną reguliuoja keletas skirtingų mechanizmų – E. coli gali įvertinti paties triptofano kiekius (per represoriaus sistemą, kurioje triptofanas veikia kaip korepresorius) ir triptofanil-tRNR kiekius (per ateniuatoriaus kotrolės sistemą) – Ateniuatorius taip pat leidžia reguliuoti triptofano sintezę, atsižvelgiant į kitų aminorūgščių kiekius
Policistroninė mRNR
Dauguma koordinuoto genų reguliavimo vyksta dėl genų susigrupavimo į operoną, kurį reguliuoja vienas promotorius ir nuo kurio yra transkribuojama viena policistroninė mRNR
Reguliaciniai (atsako, kontrolės) elementai
Transkripcinėje reguliacijoje dalyvauja dviejų pagrindinių tipų reguliaciniai baltymai  Represoriai  Jungiasi prie DNR ir nuslopina transkripciją  Aktyvatoriai  Jungiasi prie DNR ir skatina transkripciją
Regulonas
Kai kurių fiziologinių procesų metu suderintai yra reguliuojami ne pavieniai genai ar operonai, o ištisos genų ar operonų, išsidėsčiusių skirtingose genomo vietose, grupės – Bakterijų sporuliacija – Bakterijų atsakas į šiluminį šoką – Toksinų sintezė • Tokios suderintai reguliuojamų genų ar operonų grupės yra vadinamos regulonu
Represuojami genai
Korepresoriai jungiasi prie represorių ir skatina juos jungtis prie DNR  Inhibitoriai jungiasi prie aktyvatorių ir neleidžia jiems prisijungti prie DNR  Genai, reguliuojami tokiu būdu, yra vadinami represuojamais
Ribojungiklis
Viena iš bakterijų genų raiškos reguliavimo forma yra mRNR sekos panaudojimas tą mRNR koduojančio geno ekspresijai reguliuoti  Kadangi šios sekos veikia tą pačią molekulę, kurioje yra koduojamos, jas galima priskirti prie cis veikiančių reguliacinių elementų  Šie reguliaciniai elementai yra vadinami ribojungikliais (riboswitches).  Jie yra mRNR elementai, prisijungiantys metabolitus ar metalų jonus kaip ligandus, ir reguliuojantys mRNR raišką per alternatyvias struktūras, kurios susidaro dėl ligandų prisijungimo
Signalo perdavimo kelias
Dažnai tai vyksta per signalo perdavimo kelią, kai geno veiklą reguliuojantis signalas yra perduodamas iš ląstelės ar organizmo aplinkos į citoplazmą, o po to – į branduolį. • Pavyzdys – Dorsal signalo perdavimo kelias drozofilos ląstelėse
Splaisingas
Intronų pašalinimas
Splaisingo enhanseris
• Splaisingo enhanseriai – skatina sunkiai atpažįstamų splaisingo vietų panaudojimą
Splaisingo represorius
Splaisingo represoriai – blokuoja 3’ splaisingo vietos atpažinimą, dėl to naudojama sekanti splaisingo vieta
Splaisosoma
Splaisosoma iš pirminio transkripto pašalina intronus ir tiksliai sujungia likusius egzonus
Stop kodonas
Transliacija sustoja ties šiuo kodonu
Struktūrinis genas
Struktūrinis genas yra tas, kuris koduoja polipetidą  Kai toks genas yra transkribuojamas, susidaro RNR transkriptas, vadinamas informacine RNR (mRNR= messenger RNA)
Teigiama transkripcijos kontrolė
Transkripcinė reguliacija, vykdoma aktyvatorių, vadinama teigiama kontrole
Topologiškai asocijuojantis domenas (TAD)
Genomo regionai, kur kiekviename jų esanti DNR tarpusavyje sąveikauja daugiau, nei su kitomis genomo vietomis
Transkripcija
Genetinės informacijos nurašymo procesas nuo DNR matricinės grandinės į informacine mRNR molekulę
Transliacija
Baltymų sintezės procesas, kai mRNR kodonai verčiami į aminor. sekas
Uždaras promotoriaus kompleksas
DNR seka su RNR pol, kai DNR promotoriaus regionas nedenatūravęs, transkripcijos inicicijos kompleksas
Bendrieji transkripcijos faktoriai
Būtini baziniai transkripcijai baltymai, kurie jungiasi prie DNR ir yra reikalingi RNR pol jungtis prie pomotoriaus