Genetika II
🇬🇧
In English
In English
Practice Known Questions
Stay up to date with your due questions
Complete 5 questions to enable practice
Exams
Exam: Test your skills
Test your skills in exam mode
Learn New Questions
Manual Mode [BETA]
The course owner has not enabled manual mode
Specific modes
Learn with flashcards
Complete the sentence
Listening & SpellingSpelling: Type what you hear
multiple choiceMultiple choice mode
SpeakingAnswer with voice
Speaking & ListeningPractice pronunciation
TypingTyping only mode
Genetika II - Leaderboard
Genetika II - Details
Levels:
Questions:
49 questions
🇬🇧 | 🇬🇧 |
Kodonas | Groups of three nucleotide bases form a codon that specifies one of the 20 naturally occurring amino acids used in protein synthesis. |
Anticodone | A three-nucleotide codon sequence in the mRNA base-pairs with a three-nucleotide antico don sequence in the transfer RNA |
Ateniuatorius | This stem-loop structure, referred to as the terminator, or attenuator, causes transcription of the operon to be terminated. |
Promotorius | The DNA region that RNA polymerase associates with immediately before beginning transcription is known as the promoter. |
Atviras promotoriaus kompleksas | After the holoenzyme induces the DNA to dena- ture in a small region, the RNA polymerase and DNA form an open promoter complex |
A consensus sequence. | If, however, some variation appears in the sequence, but certain nucleotides occur at a high frequency (significantly greater than by chance), we refer to those nucleotides as mak- ing up a consensus sequence. |
Closed promoter complex | This initiation complex is initially referred to as a closed promoter complex because the DNA has not denatured in the promoter region |
Operon | An operon is several genes that encode proteins that are involved in a related process, which are expressed on a single mRNA that is under the transcriptional control of a single promoter. |
Intronas | These intervening sequences, or introns, are transcribed RNA sequences that are removed in the nucleus before the mature RNA is transported into the cytoplasm |
Exons | The segments of the gene between the introns, which are transcribed and pres- ent in the mature RNA molecule are termed exons. |
Spliceosome | The protein–RNA complex required for the removal of the introns from nuclear pre-mRNA is called a spliceosome. |
Alternatyvus sigma faktorius | Pvz, sigma32. Apsaugo nuo neigiamo temperatūros poveikio. Htpr genas saugo info apie ši faktoriu, jis jungiasi prie HSP geno promotoriaus. |
Baltymai aktyvatoriai | Reguliaciniai baltymai, skatinantys transkripciją, vadinami aktyvatoriais |
Baltymai represoriai | Reguliaciniai baltymai, slopinantys transkripciją, vadinami represoriais |
Bendrieji transkripcijos faktoriai | Transkripcijos faktoriai leidžia RNR polimerazei prisijungti prie promotoriaus ir suformuoti uždarą promotoriaus kompleksą Po prisijungimo DNR denatūruojama, susiformuojant pūslei, vadinamai atviru polimerazės kompleksu arba tiesiog atviru kompleksu |
CpG sala | CpG salos yra genomo srityse, kuriose yra didelis CpG kiekis – Jų ilgis yra 1-2 KB – Išsidėsčiusios kelių šimtų bazių porų atstumu prieš srovę arba pasroviui nuo transkripcijos starto vietos cpg sailensina gena CG pasikartojimų ruožai(kuriuos CpG nustato gretimose bazėse, o ne bazių porose). šios sekos randamos promotoriuose ir transkripcijos pradžios regionuose daugelyje genų, gali būti metilinamos, kad mažintų geno raišką |
Domenas | Transkripcijos faktorių baltymai turi regionus, vadinamus domenais, atliekančius specifines funkcijas Vienas domenas gali būti jungimosi su DNR vieta Kitas domenas gali būti jungimosi su efektoriaus molekulėmis vieta Motyvas yra domenas ar jo dalis, kurio(s) struktūra yra labai panaši daugelyje skirtingų baltymų |
Motyvas | Motyvas yra domenas ar jo dalis, kurio(s) struktūra yra labai panaši daugelyje skirtingų baltymų |
Esminiai genai | Nereguliuojami genai vadinami esminiais (constitutive) Jų raiškos lygis iš esmės yra pastovus Dažniausiai esminiai genai koduoja baltymus, būtinus organizmui išgyventi |
Genetinis kodas | Kodonus sudaro 3 bazės • Nepersidengiantis • Perteklinis/išsigimęs (daugiau nei vienas kodonas koduoja kai kurias aminorūgštis) • Iššifruotas naudojant dirbtinai susintetintas mRNR (pvz., poliU) ar trinukleotidus |
Geno raiška | Genų raiška (ekspresija) yra procesas, kurio metu ląstelėse geno DNR seka yra verčiama į transkripto RNR seką, o po to dekoduojama iki aminorūgščių sekos polipeptide. |
Histonų kodas | Histonų kodo hipotezė sako, kad modifikacijos specifiškai keičia genetinio kodo realizavimą • Histonų variantų įjungimas į nukleosomas vietoje kanoninių histonų |
Histonų variantai | Histono 3 variantai – Histonas H3.3 dalyvauja transkripcijos aktyvacijoje – CENPA (Centromere Protein A) baltymas yra būtinas centromeros chromatinui susiformuoti • H2A variantai – mH2A pakeičia standartinį histoną H2A, vykstant X chromosomos inaktyvinimui – H2AZ aktyvina transkripciją • Histonų variantų įsijungimui į chromatiną padeda kiti baltymai |
Induktoriai | Kai kada mažos efektorių molekulės gali sustiprinti transkripciją Tokios molekulės vadinamos induktoriais Induktoriai veikia dviem būdais Prisijungia prie aktyvatorių ir paskatina juos jungtis prie DNR Prisijungia prie represorių ir neleidžia jiems jungtis prie DNR Genai, reguliuojami tokiu būdu, yra vadinami indukuojamais |
Indukuojami genai | Kai kada mažos efektorių molekulės gali sustiprinti transkripciją Tokios molekulės vadinamos induktoriais Induktoriai veikia dviem būdais Prisijungia prie aktyvatorių ir paskatina juos jungtis prie DNR Prisijungia prie represorių ir neleidžia jiems jungtis prie DNR Genai, reguliuojami tokiu būdu, yra vadinami indukuojamais |
Inhibitoriai | Inhibitoriai jungiasi prie aktyvatorių ir neleidžia jiems prisijungti prie DNR |
Koduojanti grandinė | DNR grandinė, kuri yra transkribuojama, vadinama matricine grandine Priešinga jai grandinė yra vadinama koduojančia grandine arba reikšmine grandine |
Korepresoriai | Korepresoriai veikia prisijungdami prie transkripcijos faktorių, jau prisijungusių prie DNR. Daugelis transkripcijos faktorių, priklausomai nuo situacijos, gali veikti ir kaip aktyvatoriai, ir kaip represoriai. |
Neigiama transkripcijos kontrolė | Transkripcinė reguliacija, vykdoma represorių, vadinama neigiama kontrole |
Operonas | Operonas yra reguliacinis genomo vienetas, sudarytas iš kelių struktūrinių genų, kontroliuojamų vieno promotoriaus Jis koduoja policistroninę mRNR, turinčią dviejų ar daugiau struktūrinių genų koduojančias sekas Jis leidžia bakterijai koordinuotai reguliuoti grupę genų, kurie koduoja baltymus, atliekančius panašias funkcijas |
Perteklinė kontrolė | Kai kurie aminorūgščių sintezės operonai yra reguliuojami tik per ateniuacijos mechanizmą – Histidino operonas (his) E. coli, kuriame lyderio peptide yra 7 histinai iš eilės; – trp operonas B. subtilis, kuriam reikia 11 triptofano molekulių ateniuacijai vykti. • Kitais atvejais yra būdinga perteklinė kontrolė, t.y. operoną reguliuoja keletas skirtingų mechanizmų – E. coli gali įvertinti paties triptofano kiekius (per represoriaus sistemą, kurioje triptofanas veikia kaip korepresorius) ir triptofanil-tRNR kiekius (per ateniuatoriaus kotrolės sistemą) – Ateniuatorius taip pat leidžia reguliuoti triptofano sintezę, atsižvelgiant į kitų aminorūgščių kiekius |
Policistroninė mRNR | Dauguma koordinuoto genų reguliavimo vyksta dėl genų susigrupavimo į operoną, kurį reguliuoja vienas promotorius ir nuo kurio yra transkribuojama viena policistroninė mRNR |
Reguliaciniai (atsako, kontrolės) elementai | Transkripcinėje reguliacijoje dalyvauja dviejų pagrindinių tipų reguliaciniai baltymai Represoriai Jungiasi prie DNR ir nuslopina transkripciją Aktyvatoriai Jungiasi prie DNR ir skatina transkripciją |
Regulonas | Kai kurių fiziologinių procesų metu suderintai yra reguliuojami ne pavieniai genai ar operonai, o ištisos genų ar operonų, išsidėsčiusių skirtingose genomo vietose, grupės – Bakterijų sporuliacija – Bakterijų atsakas į šiluminį šoką – Toksinų sintezė • Tokios suderintai reguliuojamų genų ar operonų grupės yra vadinamos regulonu |
Represuojami genai | Korepresoriai jungiasi prie represorių ir skatina juos jungtis prie DNR Inhibitoriai jungiasi prie aktyvatorių ir neleidžia jiems prisijungti prie DNR Genai, reguliuojami tokiu būdu, yra vadinami represuojamais |
Ribojungiklis | Viena iš bakterijų genų raiškos reguliavimo forma yra mRNR sekos panaudojimas tą mRNR koduojančio geno ekspresijai reguliuoti Kadangi šios sekos veikia tą pačią molekulę, kurioje yra koduojamos, jas galima priskirti prie cis veikiančių reguliacinių elementų Šie reguliaciniai elementai yra vadinami ribojungikliais (riboswitches). Jie yra mRNR elementai, prisijungiantys metabolitus ar metalų jonus kaip ligandus, ir reguliuojantys mRNR raišką per alternatyvias struktūras, kurios susidaro dėl ligandų prisijungimo |
Signalo perdavimo kelias | Dažnai tai vyksta per signalo perdavimo kelią, kai geno veiklą reguliuojantis signalas yra perduodamas iš ląstelės ar organizmo aplinkos į citoplazmą, o po to – į branduolį. • Pavyzdys – Dorsal signalo perdavimo kelias drozofilos ląstelėse |
Splaisingas | Intronų pašalinimas |
Splaisingo enhanseris | • Splaisingo enhanseriai – skatina sunkiai atpažįstamų splaisingo vietų panaudojimą |
Splaisingo represorius | Splaisingo represoriai – blokuoja 3’ splaisingo vietos atpažinimą, dėl to naudojama sekanti splaisingo vieta |
Splaisosoma | Splaisosoma iš pirminio transkripto pašalina intronus ir tiksliai sujungia likusius egzonus |
Stop kodonas | Transliacija sustoja ties šiuo kodonu |
Struktūrinis genas | Struktūrinis genas yra tas, kuris koduoja polipetidą Kai toks genas yra transkribuojamas, susidaro RNR transkriptas, vadinamas informacine RNR (mRNR= messenger RNA) |
Teigiama transkripcijos kontrolė | Transkripcinė reguliacija, vykdoma aktyvatorių, vadinama teigiama kontrole |
Topologiškai asocijuojantis domenas (TAD) | Genomo regionai, kur kiekviename jų esanti DNR tarpusavyje sąveikauja daugiau, nei su kitomis genomo vietomis |
Transkripcija | Genetinės informacijos nurašymo procesas nuo DNR matricinės grandinės į informacine mRNR molekulę |
Transliacija | Baltymų sintezės procesas, kai mRNR kodonai verčiami į aminor. sekas |
Uždaras promotoriaus kompleksas | DNR seka su RNR pol, kai DNR promotoriaus regionas nedenatūravęs, transkripcijos inicicijos kompleksas |
Bendrieji transkripcijos faktoriai | Būtini baziniai transkripcijai baltymai, kurie jungiasi prie DNR ir yra reikalingi RNR pol jungtis prie pomotoriaus |