Hvad er random genetisk drift?
Hvilket effekt har det? | Random ændring i allel frekvenser over generationer.
Drift I små populationer medfører:
Sjældne alleler bliver tabt.
Der kommer ofte et våbenkapløb mellem patogener og værter
Sommetider opstår skadelige sjældne alleler. Drift kan få mængden af dem til at stige. Hvis populationen er lille vil den skadelige allel have en høj frekvens fra start.
MCH er involveret i pathogen resitance:
MHC - mating choice (kvinder vil helst have mænd der dufter (alleler) der er så forskelligt fra deres egne).
Større pathogen resistance.
MHC kan genkende peptider fra pathogener - de binder og T-cellerne angriber.
Hvis disse alleler tabes grundet drift = tab af adaptive potentiale. |
Forklar tab af allel variation og heterozygositet | I små populationer formindskes antallet af alleler.
Antallet af alleler falder hurtigere (tænk tid i generationer) end heterozygositeten især ved bottleneck.
Loss of allelic variation er også en måde at måle genetisk variation på (ligesom heterozygositet). Det er givet ved (1-p)^2N.
Loss of heterozygositet er givet ved h = -1/2N (rate af decline in h per generation). |
Forklar inbreeding
Nævn de to typer
Hvordan kan det mindskes? | Når der er inbreeding er der individer der er homozygoter for alleler som er IBD (identical by descent). Dette sker nemmere i små populationer, da der jo nødvendigvis er færre alleler i puljen.
Når alleler er IBD kalder man dem for autozygote.
Inbreeding og mangel på heterozygositet/stigning i homozygositet sættes tit lig med hinanden.
Hvis homozygoter med alleler der er IBD har lavere fitness kan det lede til inbreeding depression.
To typer inbreeding:
Inbreeding hvor det skyldes non-random mating, hvor mating mellem relatives foretrækkes.
Inbreeding hvor det skyldes at populationen er lille, og de fleste individer derfor er relaterede efter et par generationer.
FIS (inbreeding coefficient) er proportionen af variation i en subpopulation, som individet indeholde.
Høj FIS indebærer en betydelig grad af indavl (den indeholde meget af populationens variation).
Indbreeding stiger over generationer. Den er cumulative - hvis pop størrelsen stiger, kan inbreeding stoppe med at stige men ikke falde.
Det kan mindske ved: Migration (gene flow), genetic rescue, mutation. |