CDNR neturi intronų pasekmės:

Leidžia iš karto tyrinėti tik koduojančias geno sekas  2. Gali vykti koduojamo baltymo raiškabe papildomų potranskripcinių modifikacijų  Tai ypač svarbu tada, kai šeimininko ląstelės nesugeba vykdyti splaisingo (pvz., kai eukariotų genas yra klonuojamas į bakterijų ląsteles)