Hvordan tester man for HW-ligevægt?

Simpel måde: Bruger allelfrekvenserne (beregnes ud fra observerede genotyper) og beregner de forventede genotypefrekvenser. Herefter chi^2 test: Først for hver genotype, hvorefter resultaterne summes. Frihedsgrad = antal mulige genotyper – antal alleler, for at se om der er forskel mellem observeret og forventet. Null-hypotesen er at populationen er i HW-proportioner. Exact tests: God at bruge i conservation sammenhænge, fordi sample size ofte er lille i den sammenhæng, og det kan skabe problemer med Chi^2-test. Man beregner sandsynlighederne for alle mulige samples under antagelsen at null-hypotesen er sand. Dette ændrer ved X^2-værdien der skal til for at acceptere/forkaste null-hypotesen, på en måde så det tager højde for lille sample size. Bonferroni correction: Beregnes ved Signifikans niveau/antal tests. Bruges når man laver multiple testing for undgå fejl, ved at korrigerer den kritiske p-værdi (som plejer at være 0,05). Meget konservativt, i dag bruger de fleste False Discovery Rate. Man bruger programmer til det nu, vi har brugt GenePop.