Question:
Forklar hvordan man kan bruge Runs of Homozygosity til at undersøge for indavl
Author: Agnes Kejser HansenAnswer:
Runs of Homozygosity: Når der er inbreeding er der store ’runs’ of chromosomes der er homozygote. Dem kalder man runs of homozygosity. Så kigger man på længden af dem ift den totale længde af genomet og beregner en F på baggrund af det. Der beregnes den ægte mængde inbreeding, fremfor den forventede. Man kan have forskellige tresholds for hvornår noget et ROH. I et ROH skal der strictly kun være homozygote i en længere række (alt efter din treshold). Tresholden er ligesom hvor meget dit ROH må afbrydes af en heterozygot. Fx parring imellem halv-søskende forventes af være F = 0.125. FROH = længden af genomet i ROH / totalt længde af genomet.
0 / 5 (0 ratings)
1 answer(s) in total